L’activité économique de Zarzis repose essentiellement sur le tourisme, la pêche et l’agriculture. Dans le secteur industriel, c’est l’industrie agroalimentaire qui domine. L’olivier occupe une place particulière à Zarzis où l’on compte 1 228 700 pieds occupant une superficie de 61 335 hectares dont 85 % sont en pleine production. À Zarzis, il existe un port commercial qui possède une capacité de trafic commercial de deux millions de tonnes par an ; il s’étend sur 28 hectares dont 9 000 m² de hangars, dispose d’un quai de commerce de 610 mètres pour navires de 25 000 tonnes et d’un terminal pétrolier. Il est doté depuis 1993 d’une zone franche, connue sous le nom de parc d’activité économique de Zarzis, couvrant une superficie de 38 hectares et dispose depuis 1999 d’une surface de dix hectares dans l’enceinte portuaire.

À partir de juillet 2017, le port accueille une liaison régulière vers Marseille⁵.

Les ports de pêche sont au nombre de trois, à savoir Zarzis, El Bibane et Hassi Jerbi.